eig(complex) crashes

Jean Thierry-Mieg mieg at ncbi.nlm.nih.gov
Tue Oct 21 11:20:53 CDT 2008


To: bug at octave.org
Cc: mieg
Subject: eig(complex) crashes

Bug report for Octave 3.0.3 configured for x86_64-unknown-linux-gnu

Description:
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   Computing the eigen value of a 2x2 complex matrix crashes
Repeat-By:
---------
   on brand new octave, type a single instruction
   octave:1>  eig([0,-i;i,0])
*** glibc detected *** double free or corruption (out): 0x00000000015f1890 ***
*** glibc detected *** free(): invalid pointer: 0x0000000001aad480 ***
   my gcc is a recent stable version and certainly ok even if not latest.
   we just reinstalled octave to get the newer version


Configuration (please do not edit this section):
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uname output:     Linux ace 2.6.5-7.312-smp #1 SMP Fri Jun 6 13:44:33 UTC 2008 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
configure opts:   '--prefix=/usr/local/octave-3.0.3/' 'CFLAGS=-O2'
Fortran compiler: g77
FFLAGS:           -O
F2C:              @F2C@
F2CFLAGS:         @F2CFLAGS@
FLIBS:            -L/usr/lib64/gcc-lib/x86_64-suse-linux/3.3.3 -L/usr/lib64/gcc-lib/x86_64-suse-linux/3.3.3/../../../../x86_64-suse-linux/lib -L/usr/lib64/gcc-lib/x86_64-suse-linux/3.3.3/../../../../lib64 -L/usr/lib64/gcc-lib/x86_64-suse-linux/3.3.3/../../.. -L/lib/../lib64 -L/usr/lib/../lib64 -lz -lfrtbegin -lg2c -lm
CPPFLAGS:         
INCFLAGS:         -I. -I. -I./liboctave -I./src -I./libcruft/misc
C compiler:       gcc, version 3.3.3 (SuSE Linux)
CFLAGS:           -O2
CPICFLAG:         -fPIC
C++ compiler:     g++, version 3.3.3
CXXFLAGS:         -g -O2
CXXPICFLAG:       -fPIC
LD_CXX:           g++
LDFLAGS:          
LIBFLAGS:         -L.
RLD_FLAG:         -Wl,-rpath -Wl,/usr/local/octave-3.0.3//lib/octave-3.0.3
BLAS_LIBS:        -llapack -lblas
FFTW_LIBS:        
LIBS:             -lreadline  -lncurses -ldl -lz -lm 
LEXLIB:           
LIBGLOB:          
SED:              /usr/bin/sed
DEFS:

  -DPACKAGE_NAME="" -DPACKAGE_TARNAME="" -DPACKAGE_VERSION=""
  -DPACKAGE_STRING="" -DPACKAGE_BUGREPORT="" -DOCTAVE_SOURCE=1
  -D_GNU_SOURCE=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1
  -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1
  -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DSEPCHAR=':'
  -DSEPCHAR_STR=":" -D__NO_MATH_INLINES=1 -DCXX_NEW_FRIEND_TEMPLATE_DECL=1
  -DCXX_ISO_COMPLIANT_LIBRARY=1 -DCXX_BROKEN_REINTERPRET_CAST=1
  -DCXX_ABI=gnu_v3 -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_PCRE=1 -DHAVE_REGEXEC=1
  -DHAVE_REGEX=1 -DHAVE_ZLIB_H=1 -DHAVE_ZLIB=1 -DHAVE_IEEE754_DATA_FORMAT=1
  -DF77_FUNC(name,NAME)=name ## _ -DF77_FUNC_(name,NAME)=name ## __
  -DHAVE_BLAS=1 -DHAVE_GETHOSTNAME=1 -DHAVE_GETPWNAM=1 -DHAVE_DEV_T=1
  -DHAVE_INO_T=1 -DHAVE_NLINK_T=1 -DHAVE_NLINK_T=1 -DHAVE_LONG_LONG_INT=1
  -DHAVE_UNSIGNED_LONG_LONG_INT=1 -DHAVE_SIGSET_T=1 -DHAVE_SIG_ATOMIC_T=1
  -DSIZEOF_SHORT=2 -DSIZEOF_INT=4 -DSIZEOF_LONG=8 -DSIZEOF_LONG_LONG=8
  -DHAVE_ALLOCA_H=1 -DHAVE_ALLOCA=1 -DNPOS=std::string::npos
  -DHAVE_PLACEMENT_DELETE=1 -DHAVE_DYNAMIC_AUTO_ARRAYS=1 -DSTDC_HEADERS=1
  -DHAVE_DIRENT_H=1 -DTIME_WITH_SYS_TIME=1 -DHAVE_SYS_WAIT_H=1
  -DHAVE_ASSERT_H=1 -DHAVE_CURSES_H=1 -DHAVE_DLFCN_H=1 -DHAVE_FCNTL_H=1
  -DHAVE_FLOAT_H=1 -DHAVE_GRP_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1
  -DHAVE_LOCALE_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_NCURSES_H=1 -DHAVE_POLL_H=1
  -DHAVE_PWD_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1
  -DHAVE_SYS_IOCTL_H=1 -DHAVE_SYS_PARAM_H=1 -DHAVE_SYS_POLL_H=1
  -DHAVE_SYS_RESOURCE_H=1 -DHAVE_SYS_SELECT_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1
  -DHAVE_SYS_TIME_H=1 -DHAVE_SYS_TIMES_H=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1
  -DHAVE_SYS_UTSNAME_H=1 -DHAVE_TERMCAP_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1
  -DHAVE_UTIME_H=1 -DHAVE_SSTREAM=1 -DHAVE_TERMIO_H=1 -DHAVE_SGTTY_H=1
  -DHAVE_GLOB_H=1 -DHAVE_FNMATCH_H=1 -DHAVE_FNMATCH=1 -DHAVE_GLOB=1
  -DHAVE_ATEXIT=1 -DHAVE_BASENAME=1 -DHAVE_BCOPY=1 -DHAVE_BZERO=1
  -DHAVE_CANONICALIZE_FILE_NAME=1 -DHAVE_CHMOD=1 -DHAVE_DUP2=1
  -DHAVE_ENDGRENT=1 -DHAVE_ENDPWENT=1 -DHAVE_EXECVP=1 -DHAVE_FCNTL=1
  -DHAVE_FORK=1 -DHAVE_GETCWD=1 -DHAVE_GETEGID=1 -DHAVE_GETEUID=1
  -DHAVE_GETGID=1 -DHAVE_GETGRENT=1 -DHAVE_GETGRGID=1 -DHAVE_GETGRNAM=1
  -DHAVE_GETPGRP=1 -DHAVE_GETPID=1 -DHAVE_GETPPID=1 -DHAVE_GETPWENT=1
  -DHAVE_GETPWUID=1 -DHAVE_GETTIMEOFDAY=1 -DHAVE_GETUID=1 -DHAVE_GETWD=1
  -DHAVE_KILL=1 -DHAVE_LGAMMA=1 -DHAVE_LINK=1 -DHAVE_LOCALTIME_R=1
  -DHAVE_LSTAT=1 -DHAVE_MEMMOVE=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_MKFIFO=1
  -DHAVE_MKSTEMP=1 -DHAVE_ON_EXIT=1 -DHAVE_PIPE=1 -DHAVE_POLL=1
  -DHAVE_PUTENV=1 -DHAVE_RAISE=1 -DHAVE_READLINK=1 -DHAVE_REALPATH=1
  -DHAVE_RENAME=1 -DHAVE_RINDEX=1 -DHAVE_RMDIR=1 -DHAVE_ROUND=1
  -DHAVE_SELECT=1 -DHAVE_SETGRENT=1 -DHAVE_SETLOCALE=1
  -DHAVE_SETPWENT=1 -DHAVE_SETVBUF=1 -DHAVE_SIGACTION=1
  -DHAVE_SIGLONGJMP=1 -DHAVE_SIGPENDING=1 -DHAVE_SIGPROCMASK=1
  -DHAVE_SIGSUSPEND=1 -DHAVE_SNPRINTF=1 -DHAVE_STAT=1 -DHAVE_STRCASECMP=1
  -DHAVE_STRDUP=1 -DHAVE_STRERROR=1 -DHAVE_STRNCASECMP=1 -DHAVE_STRPTIME=1
  -DHAVE_STRSIGNAL=1 -DHAVE_SYMLINK=1 -DHAVE_TEMPNAM=1 -DHAVE_TGAMMA=1
  -DHAVE_UMASK=1 -DHAVE_UNAME=1 -DHAVE_UNLINK=1 -DHAVE_USLEEP=1
  -DHAVE_UTIME=1 -DHAVE_VFPRINTF=1 -DHAVE_VSPRINTF=1 -DHAVE_VSNPRINTF=1
  -DHAVE_WAITPID=1 -DHAVE_STRFTIME=1 -DHAVE_LIBDL=1 -DHAVE_DLOPEN=1
  -DHAVE_DLSYM=1 -DHAVE_DLERROR=1 -DHAVE_DLCLOSE=1 -DHAVE_DLOPEN_API=1
  -DENABLE_DYNAMIC_LINKING=1 -DHAVE_TIMEVAL=1 -DHAVE_FINITE=1
  -DHAVE_ISNAN=1 -DHAVE_ISINF=1 -DHAVE_COPYSIGN=1 -DHAVE_DECL_SIGNBIT=1
  -DHAVE_ACOSH=1 -DHAVE_ASINH=1 -DHAVE_ATANH=1 -DHAVE_ERF=1 -DHAVE_ERFC=1
  -DHAVE_EXP2=1 -DHAVE_LOG2=1 -DHAVE_STRUCT_STAT_ST_BLKSIZE=1
  -DHAVE_STRUCT_STAT_ST_BLOCKS=1 -DHAVE_STRUCT_STAT_ST_RDEV=1
  -DHAVE_STRUCT_TM_TM_ZONE=1 -DHAVE_TM_ZONE=1 -DUSE_READLINE=1
  -DEXCEPTION_IN_MATH=1 -DRETSIGTYPE=void -DHAVE_DECL_SYS_SIGLIST=1
  -DHAVE_POSIX_SIGNALS=1 -DRETSIGTYPE_IS_VOID=1 -DHAVE_GETRUSAGE=1
  -DHAVE_TIMES=1 -DYYTEXT_POINTER=1 -DGNUPLOT_BINARY="gnuplot"


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